#

BTA

Position

 

Gene expression

Mammary-

Cluster

Gene identifier

Co-localized bovine QTL6

 

Mbp

Mammary

 

GeneAtlas2

specific expression3

expression profile4

Human

Cattle

QTL viewer

QTL Map7

1

1

3-6

93146_at

CLDN8

***

1,1,2,1

NM_199328

5387615

 

 

2

(103)

10-11

96146_at

BTG3

*

1,1,2,1

NM_006806

541054

 

·

3

 

25

96953_at

CXCL14

 

1,1,1,2

NM_004887

511771

 

 

4

 

43

93592_at

APOD

 

1,1,1,2

NM_001647

613972

 

·

5

 

51

94431_at

ST6GAL1

 

1,1,2,1

NM_173216

282073

BTA 1

 

6

 

51-57

93949_at

GNB4

 

1,1,2,1

NM_021629

5259625

 

·

7

 

74

95708_at

SERP1

*

1,1,2,1

NM_014445

528100

 

 

8

 

76

92851_at

CP

**

1,1,1,2

NM_000096

514194

 

·

9

 

81

104716_at

RBP1

 

1,2,1,1

NM_002899

537379

 

 

10

 

82

161075_at

FAM62C

 

0,1,2,1

NM_031913

526280

 

·

11

 

93

92637_at

PFKL

 

1,1,2,1

NM_001002021

508683

 

 

12

2

5

104386_f_at

ITGAV

 

0,1,2,1

NM_002210

281875

 

·

13

(87)

26

104257_g_at

PSCDBP

***

1,2,2,1

NM_004288

540450

 

·

14

 

69

100600_at

CD24

*

1,2,2,1

NM_013230

NW_930970

BTA 2

 

15

 

75

94214_at

FABP3

***

1,2,2,1

NM_004102

281758

 

·

16

 

79

97909_at

STMN1

 

1,2,1,1

NM_005563

616317

 

 

17

3

3

94367_at

UCK2

 

1,2,2,1

NM_012474

541028

 

 

18

(85)

4

99481_at

ATP1A2

 

2,1,0,1

NM_000702

515161

 

··

19

 

4

102426_at

CASQ1

 

2,1,0,1

NM_001231

508394

 

 

20

 

9

102918_at

MUC1

**

0,1,2,1

NM_002456

281333

 

 

21

 

9

97269_f_at

KRTCAP2

 

0,1,2,1

NM_173852

540389

 

 

22

 

9

99098_at

FDPS

 

1,1,2,1

NM_002004

281156

 

··

23

 

9

102960_at

RAG1AP1

*

1,1,2,1

NM_018845

520463

 

 

24

 

10

101061_at

SSR2

*

1,2,2,1

NM_003145

506530

BTA 3

 

25

 

11

100127_at

CRABP2

*

1,2,1,1

NM_001878

493998

 

 

26

 

16

98543_at

CTSS

 

1,1,1,2

NM_004079

327711

 

·

27

 

22

104477_at

FAM46C

 

0,1,2,1

NM_017709

517961

 

 

28

 

35

103421_at

FRRS1

 

0,1,2,1

NM_001013660

5165225

 

 

29

 

42-45

161677_r_at

GBP6

 

1,1,2,1

NM_198460

5136595

 

 

30

 

47

103389_at

AASS

**

0,1,2,1

NM_005763

520865

 

·

31

 

71

95642_at

ELOVL1

*

1,2,2,1

NM_022821

540348

 

 

32

4

0.75

100949_at

FAM20C

**

1,2,2,1

NM_020223

534672

 

·

33

(70)

22

96591_at

RELN

 

1,2,1,1

NM_005045

281450

BTA 4

·

34

 

26

97964_at

FKBP11

 

1,2,2,1

NM_016594

506043

 

·

35

 

50

98443_at

LEP

 

1,1,1,2

NM_000230

280836

 

 

36

5

1

160829_at

PHLDA1

 

1,2,1,1

NM_007350

540135

 

 

37

(76)

4

92608_at

CSRP1

 

1,2,1,1

NM_004078

539381

 

 

38

 

7

97442_at

SLC39A8

**

0,1,2,1

NM_022154

540512

 

·

39

 

16

98063_at

Glycam1

***

1,2,2,1

NM_008134

282430

 

 

40

 

26

92994_at

LALBA

***

0,1,2,1

NM_002289

281894

 

 

41

 

29

95539_at

RAB3IP

 

1,1,2,1

NM_001024647

533284

 

·

42

 

33

92541_at

MYL1

**

2,1,0,1

NM_079420

281341

BTA 5

 

43

 

33

103002_at

B4GALT1

*

1,1,2,1

NM_001497

614365

 

 

44

 

44

161758_r_at

RBM9

 

1,1,2,1

NM_001031695

514951

 

·

45

 

49-50

104262_at

PTHLH

 

1,1,2,1

NM_002820

286767

 

 

46

 

57

93866_s_at

MGP

 

1,1,1,2

NM_000900

282660

 

 

47

 

60

95661_at

CD9

*

1,2,1,1

NM_001769

280746

 

 

48

 

69

97811_at

ARFGAP3

**

1,1,2,1

NM_014570

532778

 

··

49

 

75

93207_at

ACR

 

1,1,2,1

NM_001097

280711

 

 

50

6

0.02

100463_at

Csng

***

0,1,2,1

NM_007785

282209

 

··

51

(70)

0.02

98814_at

Csnd

***

1,1,2,1

NM_009973

282209

 

 

52

 

2-5

102774_at

EGF

 

1,1,2,1

NM_001963

5189485

 

···

53

 

3

104343_f_at

PLA2G12A

 

1,2,2,1

NM_030821

527214

BTA 6

 

54

 

15

93626_at

ABCG2

***

1,1,2,1

NM_004827

505219

 

···

55

 

22

98994_at

Slc34a2

***

1,2,2,1

NM_006424

282484

 

 

56

 

39

160549_at

TPARL

**

1,1,2,1

NM_018475

532600

 

···

57

 

45

99065_at

Csnk

***

0,1,2,1

NM_005212

281728

 

 

58

7

11

102343_at

CD320

 

1,2,2,1

NM_016579

505043

 

·

59

(69)

15

96318_at1

C19orf10

 

1,2,2,1

NM_019107

407769

 

·

60

 

16

94753_at

GNA15

 

1,1,2,1

NM_002068

5320295

BTA 7

·

61

 

58-63

103891_i_at

ELL2

**

1,1,2,1

NM_012081

5275295

 

··

62

8

4

93351_at

HPGD

 

1,1,1,2

NM_000860

512259

 

·

63

(62)

7-8

161294_f_at

CLU

*

0,1,2,1

NM_001831

280750